يتشكل المركز الاستشاري للدراسات والتوثيق من رئيس المركز والهيئة الاستشارية ، ومن مديرية الدراسات الفكرية والسياسية والقانونية، ومديرية الدراسات الانمائية، ومديرية المعلومات، ومديرية العلاقات العامة والاعلام والتسويق، ومديرية الشؤون الادارية والمالية وامانة السر.